Der Standort Berchtesgaden ist als spezialisierter Grundversorger innerhalb der Region aufgestellt. Leistungsschwerpunkte bilden Muskel-Skelett-Erkrankungen (Orthopädische Chirurgie), plastisch-ästhetische Chirurgie, Sportmedizin und Altersmedizin mit entsprechender Ressourcenbündelung in einem Zentrum für Endoprothetik und Zentrum für Altersmedizin (Akutgeriatrie, Geriatrische Reha, Alterstraumatologisches Zentrum). Schmerztherapie ergänzt das Spektrum. Im Bereich der breit aufgestellten Orthopädischen Chirurgie findet sich aufgrund der hochspezialisierten Leistungsangebote (Endoprothetik-Zentrum, Wirbelsäulen-Chirurgie) ein deutlich erweitertes Einzugsgebiet. Im Bereich der Notfallversorgung nimmt Berchtesgaden eine untergeordnete Rolle ein, mit deutlich rückläufiger Tendenz. Aufgrund seiner besonderen attraktiven geografischen Lage (Bergtourismus) und seines bereits überwiegend elektiven, hochspezialisierten Leistungsspektrums bietet sich der Standort Berchtesgaden für die Ausweitung mehrerer spezialisierter Versorgungsangebote an. Hierzu zählen ergänzende präventive und rehabilitative Angebote wie beispielsweise Vorsorgeleistungen und Gesundheitschecks im Bereich Sport- und Präventionsmedizin sowie der Orthopädie. 

In der Kreisklinik Berchtesgaden (118 Betten) wurde vor der Corona Pandemie ca. 3.300 Patienten behandelt bei einer Bettenauslastung von 82 bis 90 Prozent.  Die Mitarbeiteranzahl beträgt 234 (2020).

Zur Entwicklung der Fachklinik Berchtesgaden werden verschiedene Umbaumaßnahmen geplant. Hierbei wird unter anderem in Komfortbereiche, Ausweitung der Ästhetischen Chirurgie, Schmerztherapie, Sportmedizin und Prävention investiert.